扶桑教是在天文年間由遠祖長谷川角行所開創，其教與實行教同樣信仰富士山靈；而角行所創倡的不二分教，分立成為兩派，即實行教與扶桑教。後森同行、伊藤食行等人受於角行，共同負責組織佈道機構。食行歿後，教權統理無人繼接，而信徒的歸向也失去所依，教團與教義也一度陷於紊亂。明治初年，駿河國由𨯪野半接掌教務，扶桑教重再復興起來，進而能從教理徹底研究，遂之信徒比以前旺盛，教團組織也更堅固；並組織富士山講社，時正明治六年。明治九年，其教義及組織改名為扶桑教會，歸於神道事務局統轄。明治十五年五月別派獨立，許可為神道扶桑派之名；十二月，再改為神道扶桑教，𨯪 野半則為初代管長之職。
主祭神為天御中主神、高皇產靈神、神皇產靈神、天照大御神、月夜見神、彥火邇邇杵命；木花開耶姬等合殿配祀。
教義係根據富士山靈興教，信仰其山靈，而與實行教稍異。
教旨與實行教相同，可是扶桑教比較徹底：
㇏造化之神的無量邊神法為尊崇，並天神地祇為崇齊。
𠃌惟神的大道為修行，幽顯死生以為光明。
乚皇國的典禮要修齊，神事是歷代的儀範要追則。（此為扶桑教義的
要旨）
教所感散會，主要是作鎮祭主神之用，有扶桑教大教太祠；太祠之所在地有大教廳，設教務為總括機構。各地有教會所與講社之設備，專作佈教神事與太占、禁厭之行為，及鎮魔消災、祭事或教育信徒之用，並辦理信徒之冠婚葬祭等事宜。入為信徒者，必誓上述三條教憲，方可為信徒。